New member!
新しいメンバー、井手 聖さんが加わりました。ようこそ！ Dr Satoru IDE joined us as a new member.
2024
Farewell…
活躍いただいていた、原 雄一郎さんが、北里大学未来工学部・データサイエンス学科に転任されることになりました。ご活躍を期待しています!
fanta.bio - a new database of cis-regulatory elements
遺伝子発現を制御するゲノム領域であるシスエレメントを収載した、新しいデータベースfanta.bioを構築し、公開しました。転写されるエンハンサー (transcribed enhancer) を含むデータベースとして世界最大規模であり、ChIP-Atlas, MoG+, Togovarに収載されている転写因子結合...
2023
lymph node metastasis prediction from clinical parameters of endometrial cancer patients
子宮体がん患者において、リンパ節転移の有無を臨床パラメータを用いて予測する手法を開発しました。リンパ節郭清手術が必要かどうかを決める際の参考情報として、少しでもより良いものを、という臨床のニーズに応えるものです。 順天堂大学医学部 産科・婦人科、神奈川県立がんセンター等との共同研究の成果です。
Open call(closed)
募集は終了しました。The open call has been closed.
PADI4 gene contributes to neuronal recovary after ischemic stroke
我々が貢献した研究が論文として出版されました。一種の脂肪酸およびこれによって発現が誘導されるPADI4遺伝子が、脳卒中後の神経細胞回復に貢献することを示す成果です。脳卒中ルネサンスプロジェクト（現：東京医科歯科大学 難治疾患研究所 神経炎症修復学分野）との共同研究です。
Spatial transcriptome of mouse nasal cavity after intranasal vaccination
我々が貢献した研究が論文として出版されました。鼻腔内ワクチン接種後の免疫細胞の早期応答を、空間トランスクリプトームにより明らかにした成果です。感染制御プロジェクトとの共同研究です。
Spatial transcriptome of developmental mouse brain
プレプリントを公開しました。空間トランスクリプトームを用い、発生段階のマウス脳を丹念に調べ上げた研究です。解剖学的な構造に対応して発現する遺伝子マーカーを新しく同定した他、前障と呼ばれる領域には異なる細胞群からなる内部構造があることを示しました。脳神経回路形成プロジェクトとの共同研究です。
New member!
井田 尚美さんが新しく事務を担当してくださることになりました。昨年11月に加わったHettiarachchi Nilminiさんも含め、2023年度もがんばります！
Research proposal to AMED
AMEDへ提案していた研究課題が採択されました。核酸医薬の分野で利用いただいているD3Gを中心に、疾患におけるRNA分子完全長配列の解明に取り組みます。
Updates
更新が滞っていましたね、すみませんでした。論文リスト・メンバーリストを更新しました。
2022
Open call (closed)
研究員の募集を開始しました。バイオインフォマティクス・ゲノミクスの方面でいっしょに研究してくださる方を募集しています。詳細はこちらをご覧ください。見学や質問の問い合わせも歓迎です。 We started an open call for a researcher in the field of bioinform...
New member!
新しいメンバー、渡邊 伸昌さんが加わりました。ようこそ！ Dr Nobumasa WATANABE joined us as a new member.
Reference Genome of Crab-eating Macaque
理化学研究所、京都大学等との共同研究成果であるカニクイザルの標準ゲノム配列について プレスリリース を行いました。We have made a press release on the reference assembly of crab-eating macaque genome, which is made ...
2021
Workshop at MBSJ
日本分子生物学会の年会にて、ワークショップ「ゲノム機能・構造データを起点とするゲノム科学の展開」を開催することになりました。招待演者は、UCSC Genome BrowserのAssociate DirectorをしているRobert Kuhn先生です。UCSCゲノムブラウザ開発チームの話を直接聞けるチャンスです...
Genome Informatics at CSHL
遺伝子発現調節領域の新しい同定法に関する研究が、Cold Spring Harbor Laboratory (CSHL) で開催される国際会議Genome Informaticsの口頭演題に採択され、発表を行いました。 Our research about a method to identify cis-re...
Loss of full-length Rif1 in 2 cell embryo ZGA
発生初期の2細胞期に転写が一挙に始まる重要なイベント、接合子ゲノム活性化と、DNA複製制御因子であるRif1の全長が失われる現象とがリンクしていることを明らかにしました。ゲノム動態プロジェクトとの共同研究です。 We found that absence of full-length Rif1, a DNA re...
New member!
新しいメンバー、夏目 豊彰さんが加わりました。ようこそ！ Dr Toyoaki NATSUME joined us as a new member.
Contribution to genome medicine
都医学研NEWSに 「がんゲノム医療」の拡充へ向けた都医学研の取り組みを寄稿しました。 We contributed an article, entitled “TMIMS’s contribution to Genome Medicine in Cancer” in TMiMS NEWS.
37th TMiMS Science Cafe
8/7(土)に、オンライン・サイエンスカフェ「ゲノム配列を、みる」を開催します。まだ登録は可能ですので、ご興味のある方はぜひ。 We are going to organize 37th TMiMS Scinece Cafe
Kumamushi genome
クマムシの一種であるチョウメイムシの全ゲノムを解読し、後生動物におけるトレハロース合成経路の平行進化を明らかにしました。東京大学との共同研究です。 We sequenced the whole genome of a trehalose-producing tardigrade, Paramacrobiotus...
Genome assemblies of non-human primates
非ヒト霊長類のカニクイザルとマーモセットに関するゲノムアセンブルを発表しました。カニクイザルのゲノムアセンブルについては、世界で最もよいアセンブルになっています。理化学研究所・慶應大学他との共同研究です。 We published genome assmeblies of non-human primates, ...
MicroRNA CNVs in schizophrenia
統合失調症の患者さんの一部には、ゲノムにmicroRNAのコピー数変異があることを報告しました。統合失調症プロジェクトとの共同研究です。 We found copy number variation of miRNAs in schizophrenia’s patients genomes, in collabo...
A series of mRNA isoforms
TACC2という遺伝子のmRNAに、200以上のmRNAアイソフォームがあることを報告しました。理化学研究所、順天堂大学との共同研究です。 We discovered more than 200 mRNA isoforms in a single gene, TACC2, in collaboration wit...
Open call (closed)
研究員(特任でない)募集を開始しました。wet/dryどちらも歓迎です。詳細はこちらをご覧ください。 We started an open call for a researcher. 募集は終了しました。The open call has been closed.
2020
Report of 10th TMIMS symposium
第10回 都医学研シンポジウムの開催レポートが公開されました。A report of the on-line symposium is available.
10th TMIMS symposium
第10回 都医学研シンポジウムを開催します。We are going to have an on-line symposium.
Introductory article on TMIMS NEWS
当センターに関する紹介記事を、都医学研NEWS No.039に寄稿しました。We contributed an introductory article to TMIMS NEWS No.039.
New member!
新しいメンバー、原 雄一郎さんが加わりました。ようこそ！ Dr Yuichiro HARA joined us as a new member.
Take off !
ゲノム医学研究センターが立ち上がりました。We, Research Center for Genome & Medical Sciences, officially started.