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実験動物施設は関連法規・所内規定に基づき、所内で実施される動物実験をサポートしています。
公益財団法人東京都医学総合研究所動物実験指針第8条に基づき、動物実験計画の承認、実施状況及び結果の把握、飼養保管施設および動物実験室の承認、教育訓練、自己点検・評価、情報公開その他動物実験等の適正な実施に関して報告又は助言を行う組織として、所に動物実験倫理委員会および実験動物施設運営委員会が設置されています。