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手足口病に対して現在のところ我が国で承認されているワクチンや抗ウイルス薬はなく、効果的な予防や治療はできません。感染のリスクを少しでも下げる方法としては手洗いやうがいが重要です（図4）。
マスクの使用は口内分泌物の飛散を防ぐことができるので他人への感染を減少させるのに有効です。また、便にウイルスが排泄されているので、感染者のおむつなどは適切に処理すること、処理後の手洗いなどが重要です。
